Министерство культуры РФ объявило конкурс на реставрацию Петропавловской крепости еще 18 мая 2012 года. Начальная цена составила 150,6 млн рублей. Работы предполагалось завершить в ноябре. Однако, поскольку заявку подал только один участник, ЗАО "Балтстрой", конкурс признали несостоявшимся.
Через пять месяцев, 10 октября, министерство объявило новый конкурс с начальной стоимостью работ 134,8 млн рублей, в котором приняли участие то же ЗАО "Балтстрой", ООО "Деметра", а заявка ООО "Центр мрамор-гранит маркетинг-сервис" была отклонена. Конкурс выиграл "Балтстрой", предложив выполнить работы за 118,5 млн рублей (источник финансирования — федеральный бюджет). В связи с этим сроки окончания работ сдвинулись на 31 октября 2013 года. "Несмотря на реставрацию Петропавловский собор открыт для посещения. Закрытие в период реставрации не планируется. Сейчас ведутся работы на фасадах и главном иконостасе. Летом, возможно, мы снимем леса", — сообщили dp.ru в ГБУК "Государственный музей истории Санкт-Петербурга", которое заведует Петропавловской крепостью.
По контракту, "Балтстрой" должен восстановить вид четырех икон собора, южного киота, царских врат и живописных произведений, нанесенных на внутреннюю область купола. К примеру, подрядчик должен удалить плесень с живописи и провести ее дезинфекцию, заделать трещины в грунте живописи (их размер — до 3 мм), покрыть произведения лаком, позолотить сусальным золотом деревянные и гипсовые поверхности.